我市新冠病毒基因测序取得重大突破

5月3日，射阳县报告一例新冠病毒核酸筛查阳性病例，盐城市疾控中心新冠核酸检测团队连夜开展核酸检测复核，第一时间将复核样本送至省疾控中心进行测序，并留取样本自主开展全基因组测序，经过连续几天的奋战，5月6日上午，成功获得该样本的全基因组序列。测序结果与江苏省疾控中心进行比对，结果完全一致。

据了解，此次测序的成功开展，是我市首次将高通量测序技术运用到新冠疫情防控工作当中，为我市新冠肺炎疫情防控的精准溯源提供了坚实的技术支撑，标志着我市传染病防控分子溯源能力跻身全省前列。

“大家核酸检测的任务非常重，即便如此，同志们还是不分昼夜，挤出时间搞测序，终于完成了盐城市首例新冠样本的测序，初战告捷！”5月6日深夜，市疾控中心微检科科长陈国清难抑激动，在微信朋友圈分享了这激动人心的一刻。

能自主完成新冠样本测序，对于盐城打好疫情攻坚战，意义重大。“比如，射阳这位病例的检测结果为阳性，但他此前故意隐瞒市外行程，那么他的病毒溯源究竟如何？他到底是哪个传播链上的？通过进行新冠样本测序，我们就能精准挖掘和分析出来，这对于找出病源、控制传播风险，有极大的帮助。”陈国清说，对射阳这名大货车司机的样本测序，是我市自主完成的首例新冠样本测序。

“这台测序仪我们很早就预订了，但因为疫情对物流的影响，测序仪‘辗转’国内几个城市，最后发过来，过程比较波折，5月3日才抵达盐城。它一到这里，就帮助我们开展精准测序工作，我们工作人员也是加班加点，一直在高效运转。”市疾控中心微检科工作人员张海燕告诉记者，这也是盐城拥有的首台新冠病毒测序仪。

据了解，为精准有效处置新冠疫情，实现传染病病原快速鉴定和溯源，盐城市疾控中心在全省率先配备了高通量二代测序仪，组织骨干力量攻坚克难，先后掌握了RNA定量、模板制备、文库构建、测序、数据分析等专业技术，成功搭建起高通量测序(NGS)技术平台，确保在发生疫情时能在第一时间启动测序工作，快速锁定传染来源，发挥“一锤定音”作用。

“我们将不断补短板、强弱项，持续加强能力建设，织牢织密防控底网，坚决打赢疫情防控攻坚战。在今后的工作中，市疾控中心将继续深入夯实高通量测序技术平台能力，通过二代高通量测序技术对全市范围内新冠病毒阳性标本进行测序分析，建立新冠病毒样本本地全基因序列库，及时精准锁定传染源，溯源传播链，助力面上疫情防控工作，为我市新冠疫情防控做出更多精准的技术支持。”5月7日，市疾控中心相关负责人表示。