大鹏新区高科技农业企业发布首个亚洲家猪基因图谱

　　近日，由位于大鹏新区的中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称“基因组所”)猪基因组设计育种创新团队，于BioRxiv在线发布了中国优良地方猪——陆川猪的高质量基因组序列。该基因组序列的发表，不仅填补了亚洲家猪缺少高质量参考基因组的空白，更为基因组组装提供了新的方向。

　　我国地方猪群具有丰富的遗传多样性，是深入挖掘猪种肉质品质和抗病力等重要性状优质基因的遗传宝库。然而，随着西方商业猪种的普及，本地猪种受到了非常大的冲击，有些著名地方品种的数量比大熊猫还要稀少，部分品种甚至已经灭绝，地方猪种质资源的保护刻不容缓。

　　经过不懈的努力与技术攻关，研究团队最终获得了染色体级别的猪基因组序列，contig N50超过了18Mb，Scaffold N50 超过了140Mb。并且利用最新的组装算法和Hi-C技术，获得了完整的两套基因组序列。这是基因组研究领域的重大突破，为研究等位基因的功能互作提供了宝贵的数据和技术基础。

　　“我们本次组装得到的猪基因组，除了有很高的连续性外，更是成功地获得了2套染色体级别的基因组序列，这在基因组组装研究领域尚属首次。”项目负责人唐中林研究员兴奋地说，这意味着可以同时研究同源染色体的变异，以及来自不同亲本的等位基因功能。